Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChgaP26339 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChgaP26339 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms