Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja1P23242 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja1P23242 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms