Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PparaP23204 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PparaP23204 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PparaP23204 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PparaP23204 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PparaP23204 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PparaP23204 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PparaP23204 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms