Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb1aP21447 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms