Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms