Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lama1P19137 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms