Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RargP18911 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RargP18911 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RargP18911 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RargP18911 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RargP18911 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RargP18911 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RargP18911 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RargP18911 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RargP18911 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RargP18911 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RargP18911 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RargP18911 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RargP18911 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms