Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcna1P16388 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcna1P16388 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms