Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh2P15116 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh2P15116 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms