Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-D1P14427 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms