Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms