Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spp1P10923 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms