Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb4P10284 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms