Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprqP0C5E4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PtprqP0C5E4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PtprqP0C5E4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PtprqP0C5E4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprqP0C5E4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PtprqP0C5E4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PtprqP0C5E4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprqP0C5E4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms