Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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