Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc9P09633 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms