Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms