Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf3P05524 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf3P05524 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms