Protein–RNA interactions for Protein: P04247

Mb, Myoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MbP04247 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MbP04247 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MbP04247 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MbP04247 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MbP04247 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MbP04247 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MbP04247 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MbP04247 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MbP04247 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MbP04247 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MbP04247 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MbP04247 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms