Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casp8O89110 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casp8O89110 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casp8O89110 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casp8O89110 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms