Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb2O88838 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb2O88838 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb2O88838 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb2O88838 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb2O88838 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Spsb2O88838 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb2O88838 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb2O88838 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb2O88838 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb2O88838 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb2O88838 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb2O88838 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms