Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JtbO88824 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JtbO88824 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JtbO88824 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JtbO88824 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms