Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms