Protein–RNA interactions for Protein: O88245

Gm10139, Mszf85 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10139O88245 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm10139O88245 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10139O88245 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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