Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox6O70238 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms