Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms