Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif6O55135 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms