Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms