Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffbO54788 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffbO54788 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffbO54788 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffbO54788 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DffbO54788 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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