Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-ObO35424 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-ObO35424 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms