Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmiO35309 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmiO35309 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmiO35309 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmiO35309 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmiO35309 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NmiO35309 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmiO35309 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmiO35309 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmiO35309 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NmiO35309 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NmiO35309 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmiO35309 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NmiO35309 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NmiO35309 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NmiO35309 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NmiO35309 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NmiO35309 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NmiO35309 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NmiO35309 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms