Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Nedd9O35177 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Nedd9O35177 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Nedd9O35177 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Nedd9O35177 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Nedd9O35177 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd9O35177 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms