Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms