Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms