Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3542K7N6U2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3542K7N6U2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3542K7N6U2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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