Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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