Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm379J3QQ19 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm379J3QQ19 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm379J3QQ19 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm379J3QQ19 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Gm379J3QQ19 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm379J3QQ19 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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