Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms