Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm20828J3KMI7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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