Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms