Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms