Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms