Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r39G3UWE6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r39G3UWE6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms