Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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