Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms