Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms