Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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