Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms