Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
6030445D17RikE9Q8F9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
6030445D17RikE9Q8F9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms