Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms